Red de arrastre de fondo: Altera la estructura física y modifica la diversidad y las relaciones de abundancia relativa de diferentes especies en conexión directa con el lecho marino. El grado de alteración y la capacidad de recuperación dependen del tipo de lecho, de la intensidad de la pesca, y de la relación de frecuencia entre disturbios naturales y disturbios inducidos por la pesca (Ver Cambios de fondo).

Palangre: Afecta las poblaciones de aves y tortugas marinas. Puede afectar la capacidad reproductiva de una población, al operar sobre zonas de protección natural donde las redes de arrastre no penetran, y por su selectividad orientada a la captura de los ejemplares adultos más desarrollados. Organizaciones ambientalistas critican su uso en reservas marinas extractivistas porque afecta poblaciones reproductivas de tiburón. Para especies de boca grande, no ofrecen selectividad.

Redes agalleras: Pueden afectar las poblaciones de mamíferos marinos, especialmente delfines. En ciertas zonas también puede afectar aves nadadoras y tortugas. Recientemente la selectividad por tamaño de esta y otras artes de pesca ha sido objeto de revisión crítica, ya que podrían inducir el “enanismo” de las poblaciones objetivo, al retirar permanentemente del medio natural los ejemplares por encima de cierta talla.

Trampas: La intensidad de calado de trampas puede afectar la dinámica natural de ciertos fondos. La selectividad por tamaño recibe las mismas objeciones que el palangre y las redes agalleras respecto de la remoción de los ejemplares más desarrollados. Se ha observado con preocupación que trampas y redes agalleras perdidas pueden continuar pescando durante mucho tiempo.

Compresores: También llamados “hookas”, son objetados en ciertos caladeros artesanales porque permiten una intensificación de la pesca manual por buceo de crustáceos, moluscos y otros invertebrados, afectando su capacidad reproductiva.

Cada una de estas artes ha recibido objeciones, críticas y hasta pedidos de prohibición. Obviamente si se hiciera caso de todos esos pedidos, la única forma de pescar sería mediante técnicas neolíticas. El desafío real de los próximos años es modificar las artes para hacerlas más amigables con el medio ambiente; regular la intensidad, espacios y épocas de su uso; y determinar las áreas sensibles donde su empleo no está permitido. Será la única vía posible para que la actividad pesquera pueda cumplir al mismo tiempo con dos de las metas más importantes del milenio: la equidad socio-económica y el manejo basado en ecosistemas.